Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa17Q64016 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms