Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3gl2Q62420 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3gl2Q62420 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3gl2Q62420 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3gl2Q62420 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3gl2Q62420 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3gl2Q62420 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Sh3gl2Q62420 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Sh3gl2Q62420 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Sh3gl2Q62420 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Sh3gl2Q62420 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Sh3gl2Q62420 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Sh3gl2Q62420 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Sh3gl2Q62420 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Sh3gl2Q62420 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Sh3gl2Q62420 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Sh3gl2Q62420 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Sh3gl2Q62420 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3gl2Q62420 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms