Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AtmQ62388 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtmQ62388 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtmQ62388 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtmQ62388 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtmQ62388 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms