Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf6Q62311 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Taf6Q62311 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Taf6Q62311 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms