Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctr9Q62018 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms