Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itm2aQ61500 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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