Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Sox17Q61473 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Sox17Q61473 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Sox17Q61473 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sox17Q61473 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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