Protein–RNA interactions for Protein: Q61088

Fzd4, Frizzled-4, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fzd4Q61088 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fzd4Q61088 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms