Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ift20Q61025 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms