Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ncor1Q60974 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ncor1Q60974 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ncor1Q60974 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ncor1Q60974 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ncor1Q60974 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ncor1Q60974 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ncor1Q60974 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Ncor1Q60974 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Ncor1Q60974 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Ncor1Q60974 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Ncor1Q60974 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Ncor1Q60974 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ncor1Q60974 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Ncor1Q60974 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms