Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbbp7Q60973 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp7Q60973 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms