Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripk1Q60855 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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