Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samhd1Q60710 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms