Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ItgaeQ60677 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ItgaeQ60677 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms