Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Satb1Q60611 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms