Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8B9

Frem3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem3Q5H8B9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Frem3Q5H8B9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Frem3Q5H8B9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms