Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms