Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms