Protein–RNA interactions for Protein: Q497J0

BC100530, MCG130175, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC100530Q497J0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
BC100530Q497J0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms