Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccdc185Q3V118 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccdc185Q3V118 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccdc185Q3V118 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccdc185Q3V118 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccdc185Q3V118 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc185Q3V118 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccdc185Q3V118 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ccdc185Q3V118 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ccdc185Q3V118 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc185Q3V118 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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