Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ell2Q3UKU1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms