Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pid1Q3UBG2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms