Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U6N9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Q3U6N9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Q3U6N9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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