Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Serac1Q3U213 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms