Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem35bQ3U0Y2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem35bQ3U0Y2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms