Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hhla1Q3TYV2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hhla1Q3TYV2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms