Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TchpQ3TVW5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TchpQ3TVW5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms