Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc136Q3TVA9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc136Q3TVA9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms