Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Shcbp1lQ3TTP0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Shcbp1lQ3TTP0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Shcbp1lQ3TTP0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Shcbp1lQ3TTP0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Shcbp1lQ3TTP0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Shcbp1lQ3TTP0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shcbp1lQ3TTP0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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