Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTJ4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms