Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim43aQ3TL54 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms