Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm3Q32NY4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm3Q32NY4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm3Q32NY4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm3Q32NY4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm3Q32NY4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm3Q32NY4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm3Q32NY4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm3Q32NY4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm3Q32NY4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm3Q32NY4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm3Q32NY4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm3Q32NY4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm3Q32NY4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnnm3Q32NY4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnnm3Q32NY4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms