Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl1Q2VPR5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms