Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne9Q1RLL3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms