Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam171bQ14CH0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms