Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ptchd1Q14B62 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ptchd1Q14B62 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ptchd1Q14B62 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ptchd1Q14B62 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ptchd1Q14B62 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ptchd1Q14B62 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ptchd1Q14B62 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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ptchd1Q14B62 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ptchd1Q14B62 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ptchd1Q14B62 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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ptchd1Q14B62 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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