Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms