Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd12Q0VE29 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms