Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2bQ0KL01 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms