Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrx2Q06348 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms