Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr16c6Q05A13 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms