Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Ifnb1-201ENSMUST00000055671 750 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox12Q04890 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms