Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CkbQ04447 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CkbQ04447 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CkbQ04447 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CkbQ04447 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CkbQ04447 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CkbQ04447 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms