Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scg2Q03517 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms