Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msx2Q03358 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msx2Q03358 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msx2Q03358 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msx2Q03358 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msx2Q03358 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msx2Q03358 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msx2Q03358 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msx2Q03358 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Msx2Q03358 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msx2Q03358 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msx2Q03358 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msx2Q03358 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msx2Q03358 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msx2Q03358 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms