Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Thbs2Q03350 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Thbs2Q03350 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Thbs2Q03350 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Thbs2Q03350 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Thbs2Q03350 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs2Q03350 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs2Q03350 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs2Q03350 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs2Q03350 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs2Q03350 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs2Q03350 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs2Q03350 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs2Q03350 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Thbs2Q03350 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms