Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a2Q02788 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms