Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GscQ02591 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GscQ02591 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GscQ02591 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GscQ02591 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GscQ02591 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GscQ02591 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GscQ02591 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GscQ02591 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GscQ02591 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GscQ02591 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GscQ02591 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GscQ02591 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GscQ02591 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GscQ02591 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GscQ02591 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GscQ02591 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GscQ02591 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GscQ02591 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms