Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1cQ01815 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms