Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2bQ01097 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2bQ01097 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms